察隅，吐蕃時期建制。

明朝洪武四年(1371年)帕竹政權的釋跡堅贊當政，宗址設在科麥。

清朝設科麥縣，縣府遷至吉公。

民國元年(1912年)設縣。

1960年改設桑昂曲宗縣，縣府駐下察隅的赤通拉卡。

1966年5月改稱察隅縣，縣府駐竹瓦根鎮，屬昌都地區行政管轄。

1986年林芝地區恢復成立后，劃屬林芝地區管轄。

2015年3月，撤銷林芝地區，設立地級林芝市。察隅縣屬之。